由于小约翰·肯尼迪的特殊身份，他的意外死亡非常容易让人联想到政治谋杀。小约翰出生于美国著名的政治家族肯尼迪家族，父亲是美国历史上最年轻的总统约翰·肯尼迪（小约翰三岁时父亲遇刺身亡），叔叔是罗伯特·肯尼迪（遇刺前是总统候选人），母亲是第一夫人杰奎琳·肯尼迪。《人物》杂志还曾经评价小约翰是最性感在世男士。小约翰还是自己创办的潮流杂志《乔治》的主编。
人们对小约翰期待值很高，如果不是意外身亡，他很有可能继承父亲和叔叔的大业——竞选美国总统。
然而在1999年7月16日，这一切都戛然而止。
联想到罗伯特·肯尼迪在竞选总统期间遇刺身亡，公众确实有十足的理由怀疑小约翰的坠机是政治谋杀。
但是对于航空事故调查，最开始的调查方向绝对要囊括的一点就是驾驶员的飞行资质。
小约翰·肯尼迪是他的私人飞机的驾驶员，乘客是他的妻子卡洛琳和小姨子劳伦。他们乘私人飞机要去参加表弟的婚礼，但是飞机却坠毁在马萨诸塞州马萨诸塞葡萄园海岸附近的大西洋。
由于涉及著名的政治人物，联邦调查局承受着巨大压力。他们仔细查看了小约翰的一切信息，他亮起红灯的婚姻关系、压力过大的工作、政敌和竞争对手以及飞行训练记录等。想从中找到蛛丝马迹看看是否能与空难相关联。
结果人们发现，小约翰在长达17年的时间里飞行训练断断续续，单独飞行的经验并不多。在三百多小时的飞行经验中，只有70到75小时是单独飞行。而且他的飞行教员换来换去多达11人。其中一个飞行教员回忆小约翰时说他总是非常忙，永远都在赶时间。
小约翰出事当天谢绝了教员想陪同他飞行的请求，这似乎看得出小约翰对自身飞机驾驶能力很自信。然而事实上并不是这样，他的能力有限。
飞行训练记录显示：小约翰只有目视飞行的资质；但他没有仪表飞行的资质。
而小约翰在等待迟到的妻子时时间已经过了两个钟头，天已经慢慢黑下来。而仪表飞行是天气条件差和夜间飞行重要的技术。遇难当晚，小约翰有看过天气预报记录：天气晴好、能见度良好。
等待卡罗琳的时候天气已经开始慢慢变坏并起雾，而小约翰飞机的高度正好是天气非常糟糕的地带。而飞机一旦进入昏暗而浓雾很重的地方，小约翰的驾驶能力就难堪大任了。
小约翰需要无线电挑拨收到马萨葡萄园岛的天气预报，无线电后来在海底被打捞出来。结果证明小约翰拨频率时拨错了一个数字。这就证明，小约翰没有得到他所需要的天气数据。
小约翰本就处在一个身心透支的状态，昏暗的浓雾中他无法正常驾驶飞机。更何况他飞越海洋后，陆地上的灯光参照物已经起不到作用。小约翰陷入了空间迷向，他看到和感觉到的和飞机仪表显示截然相反。无线电的差错更会加剧他的慌乱。
小约翰这个时候要做的是忽视大脑感觉，依靠仪表飞行。遗憾的是，他不具备这个能力。小约翰经验过于不足，他无法忽视自己的身体感觉而去相信仪表。
而空间迷向在以往的航空史上已经导致无数飞行员死亡了。
这已经足够导致小约翰坠机身亡，甚至都不需要什么恐怖袭击。
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