确定分子结构有化学方法与物理方法，
化学方法是利用有机物官能团的特征反应，以确定该化合物所含官能团，还可以利用化学反应进行衍生化，通过确定衍生物的结构进一步推断原分子的结构。化学方法比较麻烦、耗时、消耗样品较多。
物理方法因所需样品量少、速度快、准确，甚至可以确定分子的三维空间结构，而显出较大的优越性，是化学方法所不能比拟的。
质谱分析：
质谱分析法是一种通过测量化学物质分子或分子碎片的质量进行分析的方法，所用的仪器称为质谱仪，所得的谱图称为质谱图。
红外光谱：
在鉴定有机化合物结构的工作中，红外光谱是一种重要的手段，它可以确定有机化合物中存在何种官能团，也可以用来推测物质的纯度。分子中的原子总是处在不断地振动中，包括伸缩振动与弯曲振动，这两种振动的频率正好位于红外区。
核磁共振氢谱：
核磁共振谱学是一门发展极为迅速的科学。因为质量数为奇数的原子核，如1h、13c、15n、19f和31p的核自旋所产生的弱磁场，在强外磁场中可以对某个特定频率的电磁波发生共振吸收，吸收频率和吸收强度可以提供分子结构的重要信息，从而发展成为核磁共振谱学
