博人和川木的战斗（第1集）：动画开头就给粉丝留下一个巨大的悬念，木叶村被毁，博人和一位名叫川木的神秘少年站在残破的火影岩上，川木说道：忍者的时代已经结束，博人回应道：但我还是忍者，说罢两人刀剑相向，博人的故事也由此拉开序幕。
鸣人就任火影之日（第18集）：这一集改编自岸本的短篇漫画《在之书》，讲述鸣人当上七代目火影那一天的故事。经过十几年的努力，鸣人终于赢得了大家的认同，实现了自己的梦想。
绯色花月篇（第19到23集）：这个篇章改编自岸本亲笔的火影忍者外传漫画《七代目火影与绯色的花月》，讲述宇智波佐良娜寻找自己的父亲佐助的故事，该篇也被称为小公主寻父篇／佐樱狗粮篇。
照亮之路（第39集）：这一集改编自岸本亲笔的火影忍者外传漫画第711话《满月照亮之路》，讲述大蛇丸之子巳月是如何诞生的，他的身世之谜、名字来源以及追寻博人的原因都将在这一集揭晓，还有大家最关心的“大蛇丸到底是母亲还是父亲”的问题，这一集蛇叔会亲自为你解答。
中忍考试篇（第53到66集）：中忍考试篇改编自2015年岸本亲自操刀的博人传剧场版电影，相较于剧场版，博人传动画增加更多的细节，比如大筒木浦式和新一代猪鹿蝶的戏份。其中还包括被吹爆的第65集，本集是火影忍者开播16年以来首次由国人担任单集导演，一个人包揽了分镜、作画、导演等主要工作，他的名字叫做黄成希。
亲子日篇（第93至95集）：亲子日篇改编自宫本深礼文案，岸本齐史绘制插图和封面的火影官方小说《鸣人新传——亲子日》，分别以漩涡鸣人、宇智波佐助和秋道丁次为主角展开的剧情，讲述父母与孩子之间的温馨日常故事。
汤烟忍法帖（第106至111集）：该篇章改编自日向翔文案，岸本齐史绘制插图和封面的火影官方小说《汤烟忍法帖》，讲述了阿斯玛的女儿猿飞未来护援退休的六代火影旗木五五开和凯皇前往汤之国执行任务的故事。里面有一句经典台词非常适合形容博人传动画：这个时代不过是精彩时代完结后的赠品！
