就在郑成功要进攻台湾的时候，原郑芝龙的旧属，时任荷兰东印度公司通事的何斌到厦门。他将台湾地图、赤嵌城木制模型，以及荷军的兵力部署情况呈献给郑成功，并极力劝说他收复台湾，这更增强了郑成功进取台湾的信心。于是他开始积极着手制定攻台方案，训练军队、修造船舰，并采取措施以麻痹占据台湾的荷军。一切准备就绪之后，郑成功于1661年2月由厦门移驻金门，令其子郑经和郑泰、黄廷等人留守金夏。
三月二十三日，郑成功亲帅大军，从金门岛料罗湾出发，吹响了攻取台湾的号角。在何斌的引导下，郑军于四月初一抵达鹿耳门港外。鹿耳门是外海船只进入台湾的北航道，但沙石淤浅，航道迂回，一向只能通行小舟，所以荷兰人放松警惕，并未派兵把守。而热兰遮城旁侧可通行大船的深水航道都处在荷军重炮的有效射程之内。为了避开荷军火力强大的防守，郑成功选择了北航道从鹿耳门进入。根据海上经验，在农历三四月交替间多有大潮，因而郑成功冒险决定鹿耳门作为突破口，趁大潮之势，顺利驶入鹿耳门港湾，在台湾民众的协助下成功登陆。
登陆后，郑成功一面立即向荷军发动军事攻势，一面致书荷方强调台湾乃中国之土地，荷方应将台湾无条件归还。但是荷兰殖民者哪里肯轻易就范，仍然进行抵抗。为了彻底摧毁荷军，郑成功先是采取正面进攻的方式，攻克了赤嵌城。郑军攻克赤嵌城后，继而采取围困的策略，封锁了荷兰殖民者在台湾的统治中心——台湾城。殖民者当局从巴达维亚，也就是今天西印度尼西亚的雅加达拼凑了七百名援军，于八月十二日达到台湾海域，与郑军展开激烈战斗。在激战中郑军英勇杀敌，用火船烧毁了荷军主力舰——克登霍夫号，并用密集的火炮，击沉了战舰科克伦号，同时还俘获了小艇三艘。战败的荷军仓皇逃回巴达维亚，再也不敢靠近台湾。荷兰援军逃离后，在台湾城被围困近九个月的荷兰殖民者，因大势已去，弹尽粮绝，不得不选择投降。
郑成功收复台湾
在签署《郑荷协议》的过程中，荷兰殖民者依然垂涎于台湾的美丽富足，不断用各种手段企图赖在台湾。但郑成功坚持台湾是中国的领土，荷兰人必须从台湾撤走。公元1662年2月1日，郑荷双方代表在大员市（今台南市安平）市政税务所签下了《郑荷协议》，完成了协议换文。至此，被荷兰殖民者侵占长达三十八年之久的宝岛台湾，重新回到了炎黄子孙的怀抱。郑成功也因此成为名垂青史的民族英雄。收复台湾后，郑成功将台湾视为抗清的一个长久基地，为了实现反清复明的心愿，他开始倾全力着手各方面的建设。在行政建制上，郑成功建立与内地相同的行政管理体制，为日后的台湾治理奠定了基础。
荷兰殖民者向郑成功投降
郑成功他第一次把我们中国的这种郡县制度传播到了台湾，他当时去收复台湾的时候，1661年他就在台湾设立了一府两县，这是我们在那里设立的最早行政建制。郑成功也确实是把台湾当做一个长远要发展的地方来建设。首先他解决了自己军队的这样一些粮饷供应的问题，他就开始把军队分布到南北各地，开始去屯垦，开发土地，去农业生产的建设，建孔庙，然后建了学校。所以中国传统文化在台湾的传播。我觉得是郑成功收复台湾之后打下了一个很好的基础。真正的中国传统文化的种子，在那以后就发展起来了。
为了改变台湾文化的落后状况，以及消除荷兰殖民教育的影响，郑成功大力发展台湾文化教育事业，把中华文化的种子播撒在祖国的宝岛，促进了台湾文化的繁荣。从此，台湾文化教育事业日益兴盛，并形成与大陆文化同根同种、同源同质、一脉相承的关系。当这一切刚刚初见成效，年仅三十九岁的郑成功，却不幸于公元1662年五月初八去世了。
郑成功去世后，郑成功之子郑经执掌了台湾的控制。公元1664年郑经着手开发经营台湾，在谘议参军陈永华制定的十年成长、十年教育、十年成聚、三十年与中原相甲乙的方略下，政权建设、经济发展、人才培养等方面都取得了长足进步，台湾呈现出迅猛发展的势头。值得一提的是，在台湾文化发展方面，文人儒士沈光文，以传统的诗文形式，写下了台湾最早的一批文学作品，成为台湾文化的开拓者。三藩之乱爆发后，郑经认为反清复明的机会来了，于1674年亲帅大军西征，但这次行动的结果是损兵折将大伤元气。
郑经当时参加西征时，主要是前面一个大的反清形势比较好，西南有吴三桂，广东有尚可喜，福建有耿精忠。郑经早起在福建时，他是跟耿精忠他们联合的，后来因为各自的一些利益争端，后面就逐渐地其他三藩势力很快就被清军慢慢的瓦解了，所以说后面就变成他自己的一股势力。当他自己一股势力去面对比较强大的清军时，他当然后面就会失败得快一些。
从此郑氏政权只能进行消极防御，郑经也再无抗清复明斗志，甚至无心过问政事，终日沉溺于花酒之中。公元1681年正月为酒色所戕的郑经中风死去，郑经死后，郑氏政权内部因争夺统治权发生动乱。接下来的三年，旱灾、水灾、火灾接踵而至，台湾经济大幅度下滑，民生困顿，台湾的前途再次陷入迷茫。对于郑氏在沿海和台湾的动向，清廷一直密切注视，并采取应对之策。在以招抚手段诱使郑氏归降的同时，也尽力进行军事打击。康熙三年十一月，福建水师提督、靖海将军施琅，奉命统率周全斌等原郑氏降清水军，开始了远征台湾的行动，但先后两次的进攻都因遭遇飓风无功而返。这致使清廷对施琅心存疑虑，康熙七年撤掉福建水师提督，召施琅进京授予内大臣。
施琅大将军画像
清政府对于施琅的态度，是经过了一个变化过程，从疑虑到逐步信任，这个和施琅本身这种很复杂的经历是分不开的。施琅早年是郑芝龙的部下，并且曾经跟郑芝龙一起降清，后来他又跟随郑成功抗清，直到顺治八年施琅和郑成功反目，又再一次投诚清朝。在各种因素的这种相互作用下，他被撤除福建水师提督整整十三年之后，直到康熙二十年，他又再次被清廷任命为福建水师提督。
福建水师提督，是决定收复台湾成败的核心人物。闻鼙鼓而思良将，康熙皇帝慎重考虑清军水师的主帅人选问题。在康熙看来，统帅水师之人，必须具备两个条件，一是熟悉水军事务，要有指挥海上作战的经验；二是要了解郑军的情况，所以施琅又再次成为福建水师提督的考虑人选。公元1681年，康熙帝命福建总督姚启圣等规划平定台湾澎湖事宜，在李光地、姚启圣的大力推荐下，施琅重新被起用为福建水师提督，抵达厦门就任，积极为攻取台湾做准备。公元1682年10月，施琅奉旨率三万水兵，在福建莆田平海练兵时遇到干旱，军中饮水奇缺，施琅令人挖掘天后宫的一处废井，泉水源源涌出且甘甜无比，足够将士饮用。施琅认为，这是妈祖赏赐甘泉给水师，特立碑于井旁，并亲书师泉。公元1683年6月14日，一切就绪，施琅遂统率水师三万余人，战船三百余艘在铜山港誓师后，浩浩荡荡地向台湾的门户澎湖进发。
而比此稍早的五月，郑将刘国轩亲率精锐部队赴澎湖驻扎，集结兵力达两万余人，在清兵有可能登陆的重要地点加强防守，共设置了14座炮台，在沿海地带构筑了长二十多里的防御工事。一方严阵以待，一方志在必得，澎湖海战在所难免。施琅首先夺取了郑军防守薄弱的八罩岛，这样就获得了船队的锚泊地，和向澎湖攻击的基地。施琅在对天候和海潮的正确判断下，率清军水师向郑军发动了全面攻击。激烈对攻之后清军大获全胜，而郑军则损失了一百九十四艘战船，一万五千余人，另有四千八百余人倒戈投降。刘国轩仅带领三百多将士，从没有清军堵截的吼门，狼狈逃回台湾，和平解决台湾已是大势所趋。
施琅收复台湾
澎湖海战结束后，清军对台湾郑氏集团已经形成大军压境的有利态势。同年闰六月十八捷报传到北京，康熙皇帝大喜，说澎湖乃台湾咽喉之地，克取台湾即在旦夕。康熙皇帝坚持和平招抚，他叮嘱施琅要以国家大局为重，抛弃郑、施两家结下的旧怨，不要以私害公，迁怒于无辜。施琅随即下令暂停军事进攻，并采取措施拖动台湾问题，向和平招抚的方向发展。施琅颁布《晓谕澎湖安民示》，表达他对澎湖贫苦百姓的同情，并采取各种优抚战俘的措施，使得战后的澎湖鸡犬不惊、人民乐业。由于施琅进驻澎台时，极力禁止杀戮和抢劫，所以当年的台湾住民对他都报有极大的好感。与此同时，施琅也积极与郑氏集团进行交涉，晓以大义，最终使郑克塽上表请降。八月十三日，施琅率军登上台湾岛，处理善后事宜。十五日，在孔庙举行了隆重的受降仪式。至此，清初持续了几十年的反清复明斗争，落下了最后一幕。
明朝皇帝后裔宁靖王朱术桂闻讯，知道反清复明已完全没有希望，自己西归故土的梦想也破灭了，竟和他的五个妃子相继自缢而亡。后人为了纪念他们，修建了墓庙合一的五妃庙。康熙二十二年六月，施琅攻下澎湖后，清廷的大臣们对于台湾的或去或留，意见不一。然而施琅却清醒地认识到，台湾的弃留是关系到国家长治久安的大事，并积极进谏说明台湾的重要性。在经过长达八个月的权衡后，康熙帝于公元1684年决定将台湾纳入大清版图。康熙二十三年四月，清廷在台湾设置一府三县，隶属于福建省，同时清廷宣布取消海禁，使得东南沿海一带流民归者如市，两岸民众自由往来。清政府顺利完成了台湾与祖国大陆的统一大业，从此台湾步入全新的发展轨道。当收复台湾的捷报传到宫中，正值中秋佳节，康熙帝欣然挥毫赋诗：万里扶桑早挂弓，水犀军指岛门空。来庭岂为修文德，柔远初非黩武功。牙帐受降秋色外，羽林奏捷月明中。海隅久念苍生困，耕凿从今九壤同。
悬处海隅二十二年的宝岛台湾，终于回到了祖国的怀抱。尽管历经许许多多的沧桑变幻，台湾与中国大陆血浓于水的亲密关系，则是始终不变的。实现统一，更是海峡两岸广大人民的共同心声。平台千古、复台千古，郑氏一人，施氏一人，历史是不会忘记那些为台湾回归祖国大陆做出重大贡献的先烈的。海天一色，荣辱与偕，台湾曲折的发展历程，向后人提供了一个镜鉴，台湾与祖国大陆血脉相连，休戚与共。
现如今美丽的宝岛台湾
