第一，从起存金额来说，两者有所区别。
20万可以起存大额存单，但不一定可以存大额存款。
大额存单按照监管要求，不论哪款产品最低起存都是20万，低于20万销售的属于违规销售，而银行大额存款的起存金额则是不固定的，且不受监管，有的银行所规定的起存金额为1万、2万或5万不等，但也有银行超过20万元。
第二，两者发行期不同。
大额存单发行机构一旦向国家监管部门报备年度发行计划并经批准后，可以采用每月滚动销售模式，投资者在全年任何时候都可以购买。
大额存款一般属于阶段性存款活动产品，比如年初“开门红”存款活动等银行推出的特色存款产品，活动结束或额度售完后，产品则下架，不再销售。
第三，两者期限也有所区别。
大额存单按照要求，只能最多包括1月、3月、6月、9月、1年、18月、2年、3年和5年等9个品种。
但大额存款期限则不受限制，由商业银行自主设定期限，比较灵活。
第四、利率不同。
由于发行大额存单的商业银行必须是全国性市场利率定价自律机制成员单位，所以大额存单利率制定有软约束，不能无底线操纵利率，引发不当竞争。
而银行大额存款定价灵活，有的银行200万起存一年利率达到4.3%，500万起存一年利率达到4.6%。
最重要的是，一般普通的大额存款利率相比同期大额存单利率来说会低不少，最近某区域性银行的3年期20万大额存单预期收益率已经达到了4.2%，随着起存额的增加，最高能够达到4.3%。
第五，两者计息规则不同。
大额存单有两种计息方式，一种是按银行当日挂牌的活期存款利率进行计算；另一种是靠档计息。
大额存单一般采用提前支取利息靠档计算的方式，即使提前支取，利率也高于活期存款利率。
例如，某大额存单存期一年利率为2.1%，存期两年利率为2.9%，存期三年利率为3.8%，起存金额为20万元。
那么，如果某位储户存款20万元，选择了存期三年的大额存单，而在第二年时，准备提前支取这20万元。
虽然三年存期还未满，但是，同样也可以享受存期两年的利息，也就是20万元*2.9%*2年=11600元。
但银行大额存款一般没有这种待遇，按照定期存款计息规则，提前支取部分按照支取日挂牌活期利率计算利息。与大额存单比较，提前支取损失的利息更多。
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