明朝末年，女真各部落之间征战不断，努尔哈赤统领的建州女真日益强大，遭到其他女真部落的抵制，与当时实力最强的叶赫部更是水火不容。为了发展壮大，努尔哈赤选择与蒙古科尔沁部落握手言和，结秦晋之好以稳定联盟。
蒙古科尔沁统治者是成吉思汗的后代，博尔济吉特氏就是孛儿只斤氏的嫡系血脉，清朝爱新觉罗家族与科尔沁博尔济吉特家族通婚最繁多，据记载清朝公主下嫁博尔济吉特家族30余人，博尔济吉特家族也有10位女子成为清朝后宫显赫的后妃。这些从科尔沁走出的姑娘们，为加强满蒙联盟做出了卓越的贡献，在清史上留下浓重的一笔。
下面简单介绍几位比较出名的科尔沁后妃：
努尔哈赤的寿康太妃：科尔沁冰图郡王孔果尔之女，博尔济吉特氏·哲哲的堂妹，在堂姐哲哲嫁给皇太极的第二年，出于政治因素嫁给了56岁的努尔哈赤做侧妃，成了堂姐的婆婆。可怜年轻守寡，膝下无子，却历经四朝，康熙四年才去世，结束了孤苦的一生。
皇太极一生志在统一女真，挥师中原，其统治时期与科尔沁联系最为密切，在盛京称帝时，册封了五大福晋，对后世影响颇为深远：
永福宫庄妃，博尔济吉特·布木布泰，大名鼎鼎的孝庄文皇后。
其中，孝端文皇后、宸妃海兰珠、孝庄文皇后皆是出自于科尔沁的博尔济吉特家族。
顺治的孝惠章皇后，是孝庄为了平息废后风波，安抚科尔沁部落的情绪而选定的，她是孝庄的侄孙女，顺治的侄女。21岁守寡，当了50年的皇太后。
顺治的淑惠妃，博尔济吉特氏，是孝惠章皇后的亲妹妹。
康熙亲政之后，满清政治已经走上正轨，想要摆脱蒙古对清朝政治的影响力，有意压制科尔沁女子在后宫的地位。和亲模式以清朝公主下嫁蒙古为主，减少蒙古后妃的人数，打破了“爱新觉罗的皇帝，博尔济吉特的皇后“的传统，开始扶持满人皇后。
康熙一朝来自科尔沁的也就慧妃（孝庄的表侄女，康熙的远房表姑）、宣妃（既是孝庄的侄孙女，康熙的同辈；又是康熙嫡母孝惠章皇后的妹妹，康熙的长辈，好乱啊）地位较高，康熙以后来自科尔沁的地位较高的妃嫔更如同凤毛麟角了。
